Grčija se šteje, da je rojstni kraj zahodne civilizacije. To je starodavna država, zgodovine in tradicije, od katerih obstaja več kot eno tisočletje. Grčija je zibelka znanosti, kulture in izobraževanja. Grški izobraževalni sistem je nastal v času antične Grčije in dosegla vrhunec v 6. stoletju pred našim štetjem Kot je že v 5. stoletju pred našim štetjem Med prostimi Atenci bilo težko najti nepismenih ljudi. V rednih šolah učili brati, pisati in računati. Učil tudi glasbo, ples, gimnastika. V institucijah visokega nivoja učil aritmetike, retorika, slovnica, glasbene teorije, dialektiko, geometrije in astronomije. V 4. stoletju pred našim štetjem Zdi se, in visokošolskega izobraževanja. Medtem ko slavni filozofi učil za pristojbino, ki želi logike, zgodovine filozofije, umetnosti oratorij.

3. maj 1837, ob prebivališča znameniti grški arhitekt Stamatis Kleantesa, je bila ustanovljena državna univerza v Atenah Ioannis Capodistrias (Univerza v Atenah). Univerza je dobila ime po prvi predsednik Grčije. Prej je bil znan kot Univerzi Otto. To je ena izmed najstarejših in najbolj prestižnih univerz v Grčiji, je bila prva univerza ne le v Grčiji, ampak tudi v vseh Balkanu in vzhodnem Sredozemlju.

Leta 1841 so bili razredi prenese na novi stavbi, ki ga je zasnoval danski arhitekt Theophil von Hansen. Stara stavba zdaj domuje muzej zgodovine na Univerzi v Atenah.

Medtem ko je univerza imela štiri fakultete: teologija, pravo, medicina in umetnosti. Filozofska fakulteta, vključenih študijo aplikativno naravoslovje in matematiko. Zanimivo je, da na začetku 52 do 33 študentov učil profesor.

Pomembna sprememba v strukturi univerze je prišlo leta 1904, ko se je Filozofska fakulteta razdeljena na dve fakulteti: znanosti in umetnosti. Fakulteta za znanosti vključuje farmacevtsko šolo, Oddelka za matematiko in fiziko. Leta 1919 je odprl oddelek za kemijo, farmacevtskih in kasneje šola prejela status oddelka.

Danes je Univerza priznan kot eden obveznic največjih raziskovalnih in učnih centrov v Evropi. To je drugi največji visokošolski zavod v Grčiji. Izobraževanje v njej na voljo za tuje študente.