Še ena atrakcija Cordoba - San Francisco Cerkve, ki je eden od tako imenovanih "ferdinandovskih" cerkvah, je dobila ime iz dejstva, da so bili med prvo krščansko cerkev zgrajena v Cordobi po reconquest od Mavrov ga je kralj Ferdinand III. Ko je bila cerkev zgrajena v delu samostana iz 13. stoletja San Pedro El Real. V samostanu, ki je pripadal frančiškanskih verskih skupnosti, da bo precej blizu času in je imel velik vpliv v verskem življenju v mestu. Znano je, da v 17. stoletju je živel sto menihov, in večina njenih blaginje in vpliv je dosegel v 18. stoletju. Toda v začetku 19. stoletja, v času pred Napoleonove vojske je bil samostan uničena, in cerkev San Francisca čudežno preživela.

Prvotno ustanovljena v gotskem slogu, danes stavba cerkve San Francisco je le deloma spominja na prvotno strukturo. Skozi 18. stoletja je bila stavba obnovljena večkrat in njena fasada obstajajo številni elementi baroka, bistveno spremenila srednjeveško podobo cerkve.

Danes je cerkev San Franciscu ni le ena najstarejših, temveč tudi eden izmed najbogatejših cerkva v Cordobi. Vsebuje veliko kulturnih vrednot nakopičenih od srednjeveškega obdobja. Na voljo je tudi zanimiva zbirka slik umetnikov 18. stoletja Cordova. To si zasluži posebno pozornost in pohištvo fino obdobje, ki se nahaja v prostorih templja.