Avguštinski samostan v Trebon je eden od najpomembnejših lokalnih zgodovinskih znamenitosti. Ustanovljena je bila za katoliške reda avguštinski štirih bratov, lastnikov mesta - Rod Rosenbergs. Ta plemenita družinski lasti do leta 1660 Trebon. Skoraj vse pomembne zgradbe v mestu, vključno z lokalno gradu, so bili financirani s temi aristokratov.

Třeboň samostan pojavil v središču mesta v XIV stoletju. 20 let po ustanovitvi samostana, ko je zgradil tempelj posvečen z imenom sv Elija in Mariji. Dejstvo, da so se lokalni prebivalci dolgo častili svetnika. Še preden je samostan tukaj obstajala župnijo Třeboň svetega Ilije. Ta samostan cerkev vsebuje nekaj veličastno umetniško delo - "Třeboň oltar", izdelana v gotskem slogu, v XIV stoletju. Ime avtorja te mojstrovine niso dosegli svoje dni, vendar je znano, da je bil lokalni in zelo spoštovana gospodar.

Samostan v lasti 7 mest, uspeval in bili srečni, dobili vse nove privilegije. Torej, leta 1389, bi lahko lokalne menihi izberejo svoje lastne opat.

Lokalni sveti bivališče ni utrpela med Hussite vojn, saj je užival pokroviteljstvom Oldrzhiha Rosenberg II.

V XVI stoletju je bil samostan zaprt zaradi moralnega padca v samostansko okolje in skoraj popolno uničenje opatije. Vse samostanska posestva postala last Rosenberg. Leta 1631, ob prigovarjanju kralja Ferdinanda II je bil obnovljen samostan. Njegov novi upravitelj je prišel iz Avstrije, in obljubil, da se ponovno vzpostavi red v namenskih samostanu.

Z 1738 je bilo vse delo rekonstrukcija končana in lokalni samostan spet postala središče izobraževanja, znanosti in vere. Do sredine XVIII stoletja, je bil samostan precej razširjen: na njenem ozemlju, obstajajo nekatere magistrski gradnja, hiša opat kapela sv Barbare.

Preživela velik požar leta 1771, je bil samostan zaprt zaradi cesarskega reforme. Danes je samostanski kompleks je odprt za obiskovalce.