Frančiškanski samostan in cerkev sv. Filipa in Jakoba so na visoki planoti na bregovih Donave v starem delu Vukovarja. Temeljni kamen za cerkev posvečena apostolov Filipa in Jakoba, je bila ustanovljena leta 1723. Gradnja cerkve je končalo 10 let kasneje, leta 1733, in gradnjo samostana je bila končana leta 1736. Kasneje je bila cerkev prezidana in obnovljena.

V letih 1896-1897 je doživel obsežno prenovo in širitev samostana in cerkve pod vodstvom dunajskega arhitekta Richarda Jordana. Po širitvi cerkve pridobila dolžino 58 metrov, kar je tretji v Sloveniji po Zagrebu dyakovskogo in katedral.

Samostan in cerkev sta značilna za stavbe v stilu "baročne Marije Terezije", razširjena na kontinentalne Hrvaške.

Med srbske agresije cerkve in samostana utrpela znatno saj doživela več kot 3000 zračnih napadov. Večina nepremičnin je bila shranjena s strani frančiškanov zunaj Hrvaške.