Ideja o oblikovanju Arheološki muzej v mestu Almeria je nastala v prvi polovici 19. stoletja. Z 1837 od najbližje mestu in njegovi okolici samostanov uspelo umakniti 196 slik in starodavnih kovancev in nagrobnikov, nakit in pripomočki, ki datira iz obdobja arabske vladavine v Španiji. Ampak zaradi številnih neznanih vzrokov odprtju muzeja v tistem času ni bil izveden. Kasneje, mnogi od teh predmetov je muzejsko zbirko izven Almeria in tudi v tujini.

Razglasitev druge španske republike je bilo dejstvo, da je leta 1933 v Almeria še vedno odprt arheološki muzej, ki se nahaja v stavbi raziskovalnega inštituta. Prvotna zbirka arheoloških ostalin muzejskih ugotovljene med izkopavanji v Almeria in njeni okolici. Leta 1934 se je muzej že začelo sodelovanje z drugimi muzejskimi zbirkami v državi. Leta 1979, v zvezi s širitvijo muzejske zbirke je preselil v stavbo, v katerem so nameščeni kolegij sv Marije Device del Mar.

Leta 1998 so ga arhitekti so zgradili Ignacio García Pedrosa in Angela Garcia de Paredes novo stavbo muzeja, ki ustreza sodobnim zahtevam. Notranjost nove stavbe, prostorne in svetle zahvaljujoč izdelanim sistemom naravne osvetlitve, minimalističen dizajn, a jasnimi geometrijskih linij in prostorske zmogljivosti. Zbiranje arheološkega muzeja Almeria so eksponati iz paleolitske obdobju do mavrske dominacije Iberskega polotoka.