Botanični vrt je bil zgrajen v 1772-1774 letih. Skoraj takoj po ustanovitvi pridružil National History Museum, ustvarjalec, ki je bil markiz Pombal. Place Garden izvoljen podkancler Univerze v Coimbri, Francisco de Lemos. Na vrtu se nahaja na zemljišču, ki se uporablja, da sodijo v šolo sv Bento, lokacijo, ki je bila uršulinke Valley. Prvi kustos vrtu je bil Domingos Vandelli, in leta 1791 ga je zamenjal Felik Alevar Brotero, profesor botanike in kmetijstva. Na vrtu se nenehno širi, je bilo v novi primerki rastlin, in v trenutku, ko je vrt pokriva površino 13 hektarjev.

Botanični vrt Univerze v Coimbri je eden najlepših vrtov v Evropi in je sestavljen iz dveh delov. En del pa se nahaja na hribu in je razdeljen na terase. Spodnja terasa se imenuje Kvadrado Central in je najstarejši del vrta. Terasa je okrašena s fontano 40s, lahko vidite dreves, zasajenih v dneh Felix Brotero kurat vrtu. Dekor elementi terase imajo veliko skupnega z dekor evropskih vrtovih v XVIII stoletju. Na drugi terasi lahko vidite rastlinjakih tropskih in subtropskih dreves in gredic celih rastlinskih družin. Te rastlinske postelje razdeljeni v skupine taksonomsko in se gojijo za uporabo študentom, botanike, kakor tudi za izmenjavo z drugimi podobnimi ustanovami po vsem svetu, ki ima botanične vrtove.

V drugem delu vrta se razprostira nad dolino skozi katero teče majhen potok, in kjer se nahaja Arboretum. Tam je veliko rastočih bambusa dreves in drugih eksotičnih rastlin. Tudi drugi del vrta je znana po svoji odlični zbirki evkaliptusa (51 vrst). Na vrtu žive perutnine. Družine rjave veverice so del ekosistema, ki je bila uspešno izvedena v juniju 1994. Proteini so bili prvi živali, ki so dobro prilagojene za okolje in začeli množiti.