Arheološki in etnografski muzej se nahaja na trgu v Cordoba Jeronimo Paez v nekdanji palači Paez de Castillejo.

Kot se pogosto zgodi s to vrsto institucij, Arheološki in etnografski muzej Cordoba v zgodovini svojega obstoja večkrat spremenili kraj njegove lokacije. Sprva Muzej je zbirka starin, zbranih iz postavk zaseženih iz samostanov in je vključen v Muzeju lepih umetnosti v Cordobi. Prvi "doma" muzejskih zbirk je bilo o prevzemu College, nato pa leta 1849 so se preselili v prostorih Sveta grafstva¸ in od leta 1861 vse muzej preselil v stavbo Charity Hospital. Od leta 1920 je muzej nahaja v Plaza de San Juan. Leta 1987, Arheološki muzej s pomočjo Anna Maria Vicente Zaragozi preselil v palačo Paez de Castillejo, kjer se nahaja danes.

Z izvedbo novega izkopavanj, raziskav in dopolnjevanje muzejskih zbirk je bilo potrebno razširiti razstavni prostor. V okviru programa mesta v letu 1998, je bil natečaj za oblikovanje nove stavbe, ki je namenjen za širitev muzeja, ki je zmagal z arhitekturno in inženirsko skupino IDOM.

Danes je zbirka arheološkega muzeja Cordoba, ki predstavlja artefakte iz različnih časovnih obdobij, ki se začnejo z zgodovino antičnega sveta, so najpopolnejši v Španiji. Na podlagi muzeja deluje tudi knjižnica, specializirana v knjigah in revijah, namenjenih za arheologijo.