Dominikanska cerkev svetega Nikolaja - eden od najstarejših templjev v Gdansku, je nastala v poznem 12. stoletju. Prvi majhna cerkev, posvečena sv Nikolaja je bila zgrajena leta 1185. Nastala je na križišču dveh pomembnih trgovskih poti: starodavno pot trgovcev in poti, ki vodi iz kraljevega gradu v Pomorjansko. Cerkev je prišel kot domačini in gostujočih trgovcev in mornarjev. V januarju 1227 Pomeranian Prince Svyatopolk dal cerkvi naročilo dominikanski v obraz Jacek Odrovatsa. Kmalu je bila cerkev spremenili v samostan. Leta 1260 je papež Aleksander IV odobri privilegij Gdansk, saj je mesto začelo prihodu romarje. Leta 1348, začela dela na širitvi samostana. Leta 1487 je bil zvezdni obok je bil zaključen osmerokotne obok.

V času reformacije je bil samostan večkrat izropali in delno uničena leta 1525 in 1576, v tem zaporedju. Menihi so bili izgnani iz samostana, nekateri od njih so bili ubiti. Po posredovanju kralja Sigismunda Avgusta leta 1567, vrnil v samostanu dominikanci.

Oktobra 1587 kralj Sigismund III prisegel svoje obveznosti v zvezi z državo, v samostanu. Od takrat začelo obdobje blaginje. Tukaj cvetel ne samo duhovno življenje, imajo pa tudi sredstva za nakup novega organa, rekonstrukcijo oltarja. V poznem 17. stoletju je bila zgrajena gotska kapela v severnem delu oltarja. Leta 1834 so Dominikanci zapustil mesto, in cerkev je postal eden od štirih katoliških v Gdansku.

Med drugo svetovno vojno je bila cerkev uničena. Po legendi, duhovnik podkupila vojakov Rdeče armade je dobre volje, zato so vojaki izropali in požgali cerkev. Aprila 1945, po 111 letih odsotnosti, so Dominikanci ponovno pojavil v Gdansku in v cerkvi.

Ob koncu 60. let je bilo zbirališče za opozicijo cerkev. Oče Louis Wisniewski organizirala srečanje s srednješolci udeležili, sledijo študenti in politike.