Zoo in muzej narave v Splitu so podarili mestu zaradi začetku XX stoletja, več naravnih zbirk. Profesor Umberto Dzhirometta leta 1923 postavljeno vprašanje ustanovitve Prirodoslovnega muzeja. Mestni svet Split je zadevo pregleda in leta 1924 ustanovil prvo muzej in Dzhirometta postal njen vodja do svoje smrti leta 1939.

V prvih letih svojega obstoja, je muzej se nahaja v eni od občinskih stavb v središču mesta. Kmalu prostor ni bilo dovolj, in muzej se je preselil v eni od stavb v parku Marjan. Skupaj z muzeju odprl majhen živalski vrt, ki zastopa nekatere vrste domačih in eksotičnih živali. Za prvi v nekdanji Jugoslaviji akvarij poleg stavbe muzeja je bila zgrajena dodaten prostor. Nekaj ​​let kasneje, je bil Oceanarium zaprta in pretvori v majhno kletko. Danes se je v Splitu Zoo ima več kot 300 vrst živali.

Stavba v parku Marjan o sovražnosti v letu 1991 je bil zaprt zaradi varnostnih razlogov. Potem se je muzej preselil v trdnjavo gripe, in po letu 1997 se je vrnil v Marian. Po letu 2000, na zahtevo zaposlenih za potrebe muzeja je bil dodeljen nov prostor, s skupno površino okoli 1156 kvadratnih metrov, v katerem je muzej začela delovati januarja 2002.

Preden je bila otvoritev novega direktorja muzeja reorganizirali muzejskih zbirk in pripovedoval številne nove izpostavljenosti (npr zbiranje nagačene živali in ptic, na oddelku za geologijo in paleontologijo, entomologijo, Oddelek vretenčarjev in nevretenčarjev, itd). So izvajali tudi delo na obdelavi in ​​sistemizaciji eksponatov, terensko delo v osrednjem delu Dalmacije, številne razstave v muzeju in izven njega. Poleg tega je muzej osebje, vključeno v številnih znanstvenih konferencah.

V pritličju muzeja gosti različne razstave, in na drugih nadstropjih hiše stalno razstavo. Vsakdo lahko kupite muzejskih dodatno gradivo o zgodovini muzeja in lokalne naravne zgodovine.