Muzej Aveiro je bila ustanovljena leta 1911 in se nahaja v zgodovinski stavbi nekdanjega dominikanskega samostana Jezusa. Samostan je bil zgrajen leta 1458. Pročelje stavbe, ki jo vidimo danes, sega v XVIII. Stavba ima tri vhode z lepimi gables in osrednji čelo stavbe je urejena s kraljevo grbom. V bližini vhoda je spomenik Saint Giovanni (John).

Atrium nekdanji samostan sedaj uporablja kot muzejski avli. Je ohranil poglavje hišo, kjer so se odvijali sestanki, in cerkev, ki sega v XV stoletja, s stebri v stilu renesanse, kot tudi številne kapele v stilu Manueline, okrašeni ploščice "azulezush." Notranjost glavne kapele cerkve je okrašena z deli lesa z pozlata XVI stoletja. Stene so okrašene s ploščicami "azulezush", ki prikazuje prizore iz življenja svetega Juans tudi visijo slike, ki je upodobljena svetnika.

Na dnu kapelice, kjer je služil za bogoslužje, je grobnica, v kateri ležijo ostanki princesa Juans, hči kralja Afonso V. Grobnica začeli graditi na ukaz kralja Pedro II, vendar ostaja princesa preselil nazaj šele leta 1711. Grobnica je okrašena s pisanimi mozaiki iz italijanskega marmorja. Vsaka stran grobu je okrašena s plošče prikazujejo prizore iz življenja princese, strop kapele je v baročnem slogu. Zasnova kraljevih grobnic delal kot arhitekt Manuel Antunes.

Princess Juan vzel meniško zaobljube v 1472g. in je živel v samostanu do svoje smrti leta 1489. Bila je znana po njeni podlagi, in, po legendi, je povezano nekaj čudežev. Leta 1673 so ga razglasili kot svetnika Juan.

Muzej ima bogato zbirko slik, skulptur, ploščice, pohištvo, keramika baroka.